Arnim Zola è tornato ed ha invaso il Triskelion sostituendo Nick Fury, tutte le guardie e il personale dello S.H.I.E.L.D. e gran parte degli studenti dell'Accademia con i suoi sintezoidi, creati a somiglianza degli umani grazie ad una nuova tecnologia olografica. Solo Spider-Man si è accorto di quanto sta avvenendo e cerca di liberare il quartier generale e salvare i suoi compagni, anche se adesso non sa più di chi fidarsi: chi è il vero amico e chi il sintezoide?