W szóstym sezonie Natsume kontynuuje swoją podróż między światem ludzi i youkai - pomagając duchom, chroniąc przyjaciół i odkrywając kolejne fragmenty przeszłości Reiko. Choć jego życie staje się coraz bardziej złożone, a kontakty z egzorcystami niebezpieczne, to właśnie relacje z innymi dają mu siłę.