In 2010 vernietigde een catastrofe 2/3 van de mensheid. Japan herstelt zich door een speciale zone in te stellen die wordt beschermd door zijn technologie, en de armsten uit te sluiten. In 2035 proberen twee tegenstanders te ontsnappen aan het 'Phantom', een organisatie die verantwoordelijk is voor het onderdrukken van elk verzet tegen het regime. Ze vluchten met een mysterieus jong meisje in het middelpunt van vele machinaties...