의뢰인의 요청에 가나가와의 이시카와로 향한 코고로와 코난, 란. 코고로는 코난과 란을 두고 혼자 의뢰인을 만나러 가고, 코고로에게 도청 장치를 붙인 코난은 관광을 즐기는 내내 코고로의 의뢰 내용을 확인하면서도 두 사람을 미행하는 인기척을 느낀다. 그리고 란이 자리를 비운 사이에 누군가의 협박을 받아 그와 함께 어딘가로 향한다. 한편, 3년 전 미해결 도난 사건과 관련하여 협박장을 받았다는 의뢰인과 함께 있던 코고로는 코난을 납치했다는 협박범의 전화를 받는데...