Peter Parker è ormai Spider-Man da un anno e, un giorno, riceve da Nick Fury (capo dello S.H.I.E.L.D.) la proposta di entrare nei ranghi della sua organizzazione. Il ragazzo inizialmente rifiuta, ma dopo una lotta con i Terribili Quattro, un gruppo composto da Klaw il signore del suono, Thundra, Wizard e Trapster, capisce di dover migliorare ed accetta la proposta di Fury.