En se promenant dans la jungle, Tarzan découvre une grande baleine à laquelle est attaché un harnais. Tarzan découvre que les baleines sont utilisées pour produire de l'énergie pour la cité de l'Atlantide. La baleine emmène Tarzan à l'Atlantide, qui se trouve dans les profondeurs de l'eau, pour enquêter. Tarzan apprend que la seule façon d'empêcher la ville d'être inondée est de continuer à produire de l'énergie. Tarzan aide à découvrir une autre source d'énergie pour que les animaux puissent être libérés et la ville sauvée.