Année 2031. L'humanité a été remplacée sur Terre par une race semblable à des insectes géants connue sous le nom de Blue. Un Sleeper appelé Yuji Kaido se réveille en ce monde cauchemardesque après avoir passé 22 ans en hibernation. On seul espoir de survie vient de l'équipe d'élite de récupération de Sleepers et d'un pilote de mecha appelés Marlene.