Kaito Kid ist es gelungen, einen Edelstein aus einem Museum zu entwenden. Auf der Unterseite des Juwels findet er eine mysteriöse Nachricht. Weil der Stein für ihn nicht weiter wertvoll ist, schickt er ihn an Inspektor Nakamori zurück. Dieser gerät daraufhin unter Verdacht, mit Kaito Kid unter einer Decke zu stecken. Kaito wiederum erfährt derweil die Wahrheit über die geheimnisvolle Phantom Lady.