Motormusene får uventet besøg af Vinnies tante Mago en rumpirat med en skummel plan og et par ondskabsfulde hajer. Udstyret med undervandsmotorcykler går musene i aktion og kæmper mod elementerne og piraterne i et forsøg på at forhindre den forræderiske pirat i at slå sig sammen med Rump i kampen om Regeneratoren.